Upravni odbor je izvršno i koordinativno tijelo FLAG-a koje organizira i obavlja tekuće poslove između dvaju zasjedanja Skupštine. Sastav Upravnog odbora čine Predsjednik, Dopredsjednik i još 9 članova Skupštine.
Jedna od najvažnijih zadaća Upravnog odbora je provođenje postupka odabira projekata u sustavu provedbe decentralizirane raspodjele financijskih sredstava iz javnih izvora kojima upravlja FLAG.
Rad Upravnog odbora temelji se na zakonskoj i podzakonskoj regulativi Republike Hrvatske i uredbama (EU) za provedbu Zajedničke ribarstvene politike, a kojima se regulira provedba CLLD-a u lokalnim ribarstvenim zajednicama. Navedeno podrazumijeva poštivanje odredbi o odgovarajućoj interesnoj zastupljenosti članova u sastavu Upravnog odbora pri čemu niti jedna pojedinačna interesna skupina nema više od 49% zastupljenosti te najmanje 40% zastupljenosti pripada predstavnicima gospodarske interesne skupine iz sektora ribarstva.
Članovi Upravnog odbora:
- Općina Medulin, predstavnik Ivan Kirac – Predsjednik FLAG-a (javna interesna skupina)
- Benđo obrt za morski ribolov, predstavnik Rikardo Šuran – Dopredsjednik FLAG-a (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- Grad Rovinj-Rovigno, predstavnica Martina Čekić Hek, članica UO (javna interesna skupina)
- Grad Vodnjan-Dignano, predstavnik Edi Pastrovicchio, član UO (javna interesna skupina)
- Udruga „Kuća o batani-Casa della batana“, predstavnik Ennio Cherin, član UO (civilna interesna skupina)
- Športsko ribolovno društvo „Banjole“, predstavnik Sandi Jurlina, član UO (civilna interesna skupina)
- Sportska ribolovna udruga „Marlera“, predstavnik Denis Beletić, član UO (civilna interesna skupina)
- Gaia d.o.o. za gospodarski ribolov i turizam, predstavnik Mauro Venier, član UO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- Medulin excursions, obrt za prijevoz putnika i morski ribolov, predstavnik Siniša Milutinović, član UO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- Aqua farma d.o.o., predstavnik Elvis Catela, član UO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- Vižula ribarstvo i trgovina d.o.o., predstavnik Igor Đokić, član UO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
Udio predstavnika javnih, civilnih i gospodarskih lokalnih socio-ekonomskih interesa u Upravnom odboru je sljedeći:
- udio predstavnika javnih lokalnih socio-ekonomskih interesa: 27,27%
- udio predstavnika civilnih lokalnih socio-ekonomskih interesa: 27,27%
- udio predstavnika gospodarskih lokalnih socio-ekonomskih interesa iz sektora ribarstva: 45,46%
