Nadzorni odbor je tijelo koje vrši nadzor nad zakonitošću rada FLAG-a. Pri tom ocjenjuje izvršenje odredbi Statuta i drugih općih akata, nadzire zakonitost financijskog i materijalnog poslovanja i pravilnost raspolaganja sredstvima te odlučuje o podnesenim prigovorima nositelja projekata na odluke Upravnog odbora o odabiru/odbijanju projekata u sustavu provedbe decentralizirane raspodjele javnih sredstava kojima upravlja FLAG.
Nadzorni odbor ima 7 članova koje bira Skupština iz redova svojih članova.
Rad Nadzornog odbora temelji se na zakonskoj i podzakonskoj regulativi Republike Hrvatske i uredbama (EU) za provedbu Zajedničke ribarstvene politike, a kojima se regulira provedba CLLD-a u lokalnim ribarstvenim zajednicama. Navedeno podrazumijeva poštivanje odredbi o odgovarajućoj interesnoj zastupljenosti članova u sastavu Upravnog odbora pri čemu niti jedna pojedinačna interesna skupina nema više od 49% zastupljenosti te najmanje 40% zastupljenosti pripada predstavnicima gospodarske interesne skupine iz sektora ribarstva.
Članovi Nadzornog odbora su:
- Općina Ližnjan-Lisignano, predstavnik Marko Ravnić – Predsjednik NO (javna interesna skupina)
- Levan, obrt za morski ribolov i knjigovodstveni servis, predstavnik Siniša Pavlović – zamjenik Predsjednika (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- Med eko servis d.o.o., predstavnik Saša Pola, član NO (javna interesna skupina)
- FARO 11 udruga za razvoj kreativnih industrija, predstavnica Ivana Čehić Rabljenović, članica NO (civilna interesna skupina)
- Ankica Piccoli, članica NO (civilna interesna skupina)
- Davor Škorić, obrt za morski ribolov, predstavnik Davor Škorić, član NO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
- R.I.S.T. TOURS d.o.o. za turizam i putnička agencija, predstavnik Aleksandar Ristovski, član NO (gospodarska interesna skupina iz sektora ribarstva)
Udio predstavnika javnih, civilnih i gospodarskih lokalnih socio-ekonomskih interesa u Nadzornom odboru FLAG-a je sljedeći:
- udio predstavnika javnih lokalnih socio-ekonomskih interesa: 28,57%
- udio predstavnika civilnih lokalnih socio-ekonomskih interesa: 28,57%
- udio predstavnika gospodarskih lokalnih socio-ekonomskih interesa: 42,86%